使用SCI-HUB下载文献全文

方法1:
直接打开http://sci-hub.bz/,输入文献的网址,PMID或者关键词进行下载。
sci-hub
方法2:
在文献下载页面的网址主域名后面加“.sci-hub.bz”,就可以下载了
例如
原页面地址:http://www.nature.com/nbt/journal/v24/n6/full/nbt1211.html
修改为:http://www.nature.com.sci-hub.bz/nbt/journal/v24/n6/full/nbt1211.html
(2016年6月3日 更新)

不会用Google,你就输在起跑线啦!

如果想实现一个东西,而这个东西又不是新事物,你首先得上网搜一下。如果是没人做出过它,先想想是不是查错了方式,然后才是努力去完成这项前无古人的任务。
自2010年,Google退出中国,百度一家独大。然而,百度搜索结果不尽人意,饱受诟病。”莆田系”事件的爆发,将百度推向舆论的风口浪尖。在百度搜索一个关键词,得到的往往是广告,甚至是虚假广告,得不到想要的信息。如果不会使用Google,你就输在起跑线啦!
如何以正确的姿势使用Google呢?推荐下面一个知乎问答。
如何用好 Google 等搜索引擎?
大多数情况下,使用关键词进行搜索就可以了。这里分享一些Google使用的小技巧。
文件类型 filetype
Google_tips_1
精确短语搜索 “ ”
Google_tips_2
排除条件 –
Google_tips_3
相关条件 related
Google_tips_4
站点搜索 site
Google_tips_5
一些Google的”镜像”网站:
http://www.googto.com/
http://www.scholarnet.cn/
http://guge.cytbj.com/
http://scholar.glgoo.com/

使用VennDiagram包绘制韦恩图

维恩图,也叫文氏图,用于显示元素集合重叠区域的图示。最简单的方法是用PPT画几个圆圈,然后标上数字。R中的VennDiagram包最多可以画5组数据的韦恩图,且图的质量可以达到发表的要求。
VennDiagram文章发表在BMC Bioinformatics杂志上,下图就是文章中的插图。
VennDiagram
安装VennDiagram包

install.packages("VennDiagram")

载入VennDiagram包

library(VennDiagram)

绘制韦恩图

list1 <- c(1,2,3,4,5,6,7,8,9,10)
list2 <- c(6,7,8,9,10,11,12,13,14,15)
list3 <- c(1,2,3,4,5,11,12,13,14,15)
venn.diagram(list(A=list1,B=list2,C=list3), "figure.tiff")

VennDiagram_figure
venn.diagram()函数最基本的两个参数就是输入和输出,输入是一个包含每组数据的list,输出指定文件名即可。venn.diagram()函数是输入是每组数据的详单,有时候我们并不知道每组数据具体元素,只是知道各组数据之间有多少交集,那该怎么办呢?
VennDiagram包提供了draw.single.venn()、draw.pairwise.venn()、draw.triple.venn()、draw.quad.venn()、draw.quintuple.venn()函数,分别绘制1-5组数据的韦恩图。
还是以上面的例子,用draw.triple.venn()作图。

draw.triple.venn(area1=10,area2=10,area3=10,n12=5,n23=5,n13=5,n123=0,category=c("A","B","C"))

area1,area2,area3表示三组数据中元素的数量,n12,n23,n13,n123表示各组数据之间交集的数量,category指定每组数据的名称。
如果要把图画得好看点,可以添加其他的修饰参数。?VennDiagram查看帮助文档。
一个可以在线绘制韦恩图的网址:
http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/